45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0257 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  357  5e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  81.11 
 
 
184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0255  PaREP1 domain-containing protein  78.33 
 
 
180 aa  249  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  77.22 
 
 
181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  66.07 
 
 
209 aa  220  7e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0229  PaREP1 family protein  61.93 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.529373  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1430  PaREP1 domain-containing protein  64.29 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0697569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  77.98 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  73.45 
 
 
183 aa  216  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1514  PaREP1 domain-containing protein  65.29 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  normal  0.593103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0363  PaREP1 domain-containing protein  67.23 
 
 
184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0334  PaREP1 domain-containing protein  67.23 
 
 
184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0469  PaREP1 family protein  64.77 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0206869  hitchhiker  0.000000022653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  67.8 
 
 
181 aa  210  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0369  PaREP1 domain-containing protein  62.71 
 
 
182 aa  197  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0859081  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  71.43 
 
 
164 aa  192  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0508  PaREP1 family protein  58.52 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0372  PaREP1 domain-containing protein  63.07 
 
 
187 aa  182  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295091  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1474  PaREP1 domain-containing protein  60.8 
 
 
188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  66.48 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  61.69 
 
 
157 aa  169  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  40.79 
 
 
167 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2014  PaREP1 domain-containing protein  39.51 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00133149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  43.98 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  38.71 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  41.56 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1316  PaREP1 domain-containing protein  38.67 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16604  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  38.65 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0129  PaREP1 domain-containing protein  55.29 
 
 
119 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192151  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  40 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0238  PaREP1 domain-containing protein  39.61 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.189081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0121  PaREP1 family protein  34.78 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  41.03 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1416  PaREP1 domain-containing protein  38.93 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  42.14 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  41.32 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1348  PaREP1 domain-containing protein  36.94 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  36.48 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1132  PaREP1 domain-containing protein  32.54 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.252197  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  32.9 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  34.9 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1300  PaREP1 domain-containing protein  34.9 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0950  PaREP1 domain-containing protein  34.46 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  36.29 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0934  PaREP1 domain-containing protein  35.34 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000142173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>