44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0258 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  69.33 
 
 
184 aa  215  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0255  PaREP1 domain-containing protein  72.67 
 
 
180 aa  205  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0229  PaREP1 family protein  61.15 
 
 
182 aa  200  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.529373  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0469  PaREP1 family protein  61.88 
 
 
190 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0206869  hitchhiker  0.000000022653 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1514  PaREP1 domain-containing protein  62.18 
 
 
188 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  normal  0.593103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  71.43 
 
 
180 aa  192  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  73.89 
 
 
183 aa  191  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1430  PaREP1 domain-containing protein  61.01 
 
 
183 aa  191  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0697569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  61.01 
 
 
209 aa  190  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  71.95 
 
 
179 aa  189  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  63.12 
 
 
181 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  71.43 
 
 
181 aa  181  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0363  PaREP1 domain-containing protein  61.78 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0334  PaREP1 domain-containing protein  61.78 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0508  PaREP1 family protein  61.54 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0369  PaREP1 domain-containing protein  56.05 
 
 
182 aa  167  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0859081  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1474  PaREP1 domain-containing protein  62.18 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  64.74 
 
 
190 aa  162  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0372  PaREP1 domain-containing protein  58.33 
 
 
187 aa  156  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295091  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  56.39 
 
 
157 aa  143  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  37.82 
 
 
167 aa  92  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  37.5 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  37.91 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2014  PaREP1 domain-containing protein  34.84 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00133149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1316  PaREP1 domain-containing protein  31.82 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16604  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0238  PaREP1 domain-containing protein  37.34 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.189081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  37.04 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0129  PaREP1 domain-containing protein  61.02 
 
 
119 aa  77  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192151  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  37.84 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1348  PaREP1 domain-containing protein  37.01 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  38.78 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  36.71 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  34.25 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  41.18 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  35.57 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1132  PaREP1 domain-containing protein  32.48 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.252197  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0121  PaREP1 family protein  30 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  37.33 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1416  PaREP1 domain-containing protein  34.23 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  37.01 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  38.89 
 
 
199 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1300  PaREP1 domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0950  PaREP1 domain-containing protein  34.48 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  0.692047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>