14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0459 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0459  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  166  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  42.86 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  47.89 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  43.84 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  38.96 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  39.71 
 
 
180 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  38.96 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  35.14 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  39.34 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  34.67 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  32.79 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  37.25 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  28.38 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  32.5 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>