162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3516 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4462  cell division protein FtsQ  43.72 
 
 
286 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  41.08 
 
 
254 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.24 
 
 
262 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.03 
 
 
262 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  41.03 
 
 
249 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  41.03 
 
 
262 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3589  cell division protein FtsQ  37.08 
 
 
274 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.6 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3777  cell division protein FtsQ  36.67 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0326352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  40.59 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  36 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  36 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  36 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  36 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.01 
 
 
218 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  36.25 
 
 
263 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  39 
 
 
262 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  36.51 
 
 
280 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  36 
 
 
276 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  36.25 
 
 
275 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
283 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.41 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.41 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.01 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.32 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.56 
 
 
256 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
284 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0651  cell division protein FtsQ  36.65 
 
 
284 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0684604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0489  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.32 
 
 
249 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  38.56 
 
 
250 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  36.72 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  35.54 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1150  cell division protein FtsQ  34.93 
 
 
245 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03255  cell division protein  52.41 
 
 
173 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0023764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  36.92 
 
 
260 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  32.64 
 
 
256 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  32.64 
 
 
260 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  34.67 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0773  cell division protein FtsQ  33.63 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  35.75 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  36.82 
 
 
246 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  33.47 
 
 
288 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  32.33 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  32.35 
 
 
286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  32.02 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  32.02 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  32.33 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.1 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.51 
 
 
289 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.71 
 
 
249 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  32.92 
 
 
289 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0361  cell division protein  32.02 
 
 
257 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00756063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.51 
 
 
289 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.68 
 
 
285 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  31.58 
 
 
287 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.62 
 
 
288 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2045  cell division protein  32.99 
 
 
278 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000010685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1966  cell division protein FtsQ  32.99 
 
 
278 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000753144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  31.14 
 
 
287 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  30.2 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  31.2 
 
 
236 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  33.49 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  35.84 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.34 
 
 
250 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.48 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  29.91 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.66 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000621629  unclonable  0.00000000000366922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2187  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
240 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2976  cell division protein FtsQ  33.5 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  29.8 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.26 
 
 
285 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3125  cell division protein FtsQ  32.82 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3541  cell division protein FtsQ  29.8 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3522  cell division protein FtsQ  29.8 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3547  cell division protein FtsQ  29.8 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  29.85 
 
 
250 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  29.19 
 
 
239 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0184  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.04 
 
 
291 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000203448  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  29.19 
 
 
239 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.35 
 
 
250 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2548  cell division protein FtsQ  29.29 
 
 
250 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0469  cell division protein FtsQ  29.29 
 
 
250 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1328  cell division protein FtsQ  29.29 
 
 
250 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64132  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3235  cell division protein FtsQ  29.29 
 
 
250 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  29.39 
 
 
287 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  29.35 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.35 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.35 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  29.35 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.85 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.86 
 
 
250 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>