59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3327 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.77 
 
 		 299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.44 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.9 
 
 		 306 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.21 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.21 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.21 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.3 
 
 		 296 aa  371  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.85 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.64 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.93 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.3 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.76 
 
 		 296 aa  363  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.64 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.64 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  58.97 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.42 
 
 		 296 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.34 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.02 
 
 		 300 aa  358  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.04 
 
 		 293 aa  355  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.98 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.49 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.66 
 
 		 296 aa  348  5e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.93 
 
 		 321 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.79 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.61 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.14 
 
 		 296 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.36 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.24 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.91 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.58 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  29.38 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.44 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  32.56 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  27.14 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.14 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  29.65 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  26.19 
 
 		 355 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  24.88 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  27.95 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  24.04 
 
 		 401 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  25.41 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  26.71 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  25.37 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  27.41 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  26.47 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  26.47 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  27.22 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  24.68 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  24.64 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  25.58 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  25.58 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  29.03 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  27.01 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  24.25 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>