16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2837 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2520  NAD+ synthase  49.36 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47785  predicted protein  27.4 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  30.45 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2840  hypothetical protein  27.76 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884921  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  26.44 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2756  hypothetical protein  26.96 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0404  hypothetical protein  26.22 
 
 		 776 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321562  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  28.74 
 
 		 827 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  22.92 
 
 		 1508 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.29 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22.43 
 
 		 1328 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  24.66 
 
 		 495 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  24.68 
 
 		 729 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01446  hypothetical protein  56.25 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  24.29 
 
 		 731 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>