57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1517 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1517  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  323  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
165 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2611  acetyltransferase, gnat family  27.01 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2638  putative acetyltransferase  27.14 
 
 
186 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30760  putative acetyltransferase  27.41 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2557  acetyltransferase  24.82 
 
 
173 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2368  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00152126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2296  aminoglycoside N(6')-acetyltransferase  24.8 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2568  acetyltransferase, GNAT family  24.8 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000832987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2335  aminoglycoside N(6')-acetyltransferase  24.8 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000459948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2555  acetyltransferase  24 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2378  acetyltransferase  24 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266217  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0826  putative acetyltransferase  25.37 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.450111  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0798  putative acetyltransferase  25.37 
 
 
230 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
161 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 
161 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.5 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2520  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  23.36 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.967337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2801  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  24.09 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000220984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.58 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.58 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3338  acetyltransferase  22 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.667425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.73 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.12 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.52 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0603  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.88 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.88 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  25 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.81 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.71 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.81 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  34.85 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.71 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.27 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  32.81 
 
 
152 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0526  acetyltransferase  35.29 
 
 
157 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
153 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  27.91 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  25.51 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  26.17 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3934  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.91 
 
 
308 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
162 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>