35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0166 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  38.76 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  32.81 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  36.98 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  32.81 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  32.81 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  32.39 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  37.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  32.81 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  32.39 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  34.98 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  31.98 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  34.96 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  31.58 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  30.04 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  34.58 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  37.1 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  34.91 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  28.48 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  33.04 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  27.19 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  27.45 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  25.19 
 
 		 481 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  26.59 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  25.69 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  23.85 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  22.01 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  23.5 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  24.36 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  21.4 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  19.63 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  19.14 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  19.14 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  19.06 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>