16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0604 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  58.14 
 
 
278 aa  316  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  44.83 
 
 
284 aa  235  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  43.37 
 
 
264 aa  195  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  35.43 
 
 
663 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  35.29 
 
 
664 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  37.08 
 
 
664 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  34.84 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  31.09 
 
 
276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  28.92 
 
 
663 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  27.92 
 
 
656 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  24.47 
 
 
672 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4905  hypothetical protein  51.22 
 
 
62 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38069  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  25.34 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  26.8 
 
 
271 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  24.76 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>