47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_rna0 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_rna0  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0078  tRNA-Gln  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0045  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0045  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  91.38 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0064  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0580  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000400154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>