26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04381 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04381  inner membrane protein YbcI  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.23 
 
 		 193 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  53.89 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  50.6 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  50.6 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  50.6 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  50.6 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  50 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  45.34 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.34 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  45.34 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65580  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  53.46 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  45.03 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  45.61 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  45.03 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  45.03 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.03 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  46.25 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.03 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  46.25 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  45.03 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.77 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  35.05 
 
 		 331 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>