55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02653 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02653    100 
 
 
204 bp  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  99.02 
 
 
264 bp  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  99.02 
 
 
264 bp  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  99.02 
 
 
264 bp  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  99.02 
 
 
264 bp  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
264 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
264 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
264 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
270 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
264 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05698  IS66 family element, Orf1 protein  98.53 
 
 
204 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0455822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  99.02 
 
 
399 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  98.53 
 
 
264 bp  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  98.03 
 
 
285 bp  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  98.53 
 
 
399 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  98.04 
 
 
264 bp  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  97.55 
 
 
264 bp  365  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  97.55 
 
 
264 bp  365  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  97.55 
 
 
264 bp  365  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  97.55 
 
 
264 bp  365  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  97.55 
 
 
264 bp  365  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  97.55 
 
 
393 bp  357  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  97.06 
 
 
264 bp  357  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  97 
 
 
264 bp  349  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01847  ISXoo3 transposase ORF A  97 
 
 
264 bp  349  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  96.57 
 
 
264 bp  349  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00733  ISXoo3 transposase ORF A  96 
 
 
264 bp  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  98.65 
 
 
498 bp  278  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  98.65 
 
 
450 bp  278  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  95.32 
 
 
774 bp  276  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02163  hypothetical protein  98.65 
 
 
147 bp  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02779  hypothetical protein  97.97 
 
 
147 bp  262  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03722  hypothetical protein  97.97 
 
 
147 bp  262  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04076    98.41 
 
 
126 bp  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01162  transposase  97.62 
 
 
126 bp  226  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01379  hypothetical protein  91.95 
 
 
216 bp  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00237  transposase  86.36 
 
 
237 bp  178  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  96.34 
 
 
1842 bp  133  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04450  transposase  90.7 
 
 
537 bp  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.468258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  81.7 
 
 
264 bp  81.8  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  100 
 
 
570 bp  81.8  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01972  ISXo8 transposase  97.56 
 
 
576 bp  73.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0687025  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  88.89 
 
 
264 bp  60  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4004    83.33 
 
 
204 bp  60  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28760  hypothetical protein  94.44 
 
 
615 bp  56  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000174621  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 
294 bp  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 
255 bp  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1133  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  96.3 
 
 
1584 bp  46.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.740048  hitchhiker  0.000205142 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  86.27 
 
 
288 bp  46.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>