26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01661 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  762    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  73.6 
 
 		 441 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 449 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  35.54 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  35.73 
 
 		 445 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  34.9 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  34.16 
 
 		 442 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  32.68 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  34.17 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 438 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  32.13 
 
 		 435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 439 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  31.75 
 
 		 436 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  31.55 
 
 		 453 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  31.03 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 439 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  26.64 
 
 		 939 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  23.96 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  24.2 
 
 		 610 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  19.26 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>