44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01520 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01520  zinc transporter ZupT  100 
 
 		 86 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  76.54 
 
 		 269 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  55.13 
 
 		 272 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  53.85 
 
 		 271 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  48.84 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  52.56 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  47.44 
 
 		 279 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  47.67 
 
 		 298 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  47.5 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  49.35 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  51.95 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  47.44 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  51.95 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  45.35 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  41.77 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  48.68 
 
 		 265 aa  72  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  45.45 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  44.19 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  44.74 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  43.21 
 
 		 390 aa  67.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  39.51 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  38.27 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  46.91 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  43.42 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  37.21 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  36.71 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  27.63 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  34.18 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  36.71 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 257 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 257 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 257 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 257 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  32.47 
 
 		 257 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>