More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00290 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00578  IS1113 transposase  97.94 
 
 
331 aa  200  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03663  IS1113 transposase  97.94 
 
 
331 aa  200  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00515  IS1113 tranposase  97.94 
 
 
331 aa  200  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0127136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00290  transposase  100 
 
 
97 aa  200  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0508565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03164  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01463  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01962  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00540363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00428  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05637  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06261  IS1113 transposase  96.91 
 
 
331 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03988  IS1113 transposase  95.88 
 
 
331 aa  196  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  55.56 
 
 
408 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  55.56 
 
 
408 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  54.44 
 
 
404 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  53.26 
 
 
408 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  53.26 
 
 
408 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  52.22 
 
 
425 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  52.22 
 
 
425 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  52.22 
 
 
425 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  52.22 
 
 
425 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  52.22 
 
 
425 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  51.11 
 
 
415 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  52.17 
 
 
408 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  52.17 
 
 
408 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  52.17 
 
 
408 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  52.17 
 
 
408 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  52.17 
 
 
408 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  48.86 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  50 
 
 
426 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  50 
 
 
295 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  50 
 
 
426 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  50 
 
 
426 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0141  transposase, mutator type  52.27 
 
 
266 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  48.84 
 
 
416 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  48.84 
 
 
416 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  48.86 
 
 
416 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  48.84 
 
 
416 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  50 
 
 
402 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  50 
 
 
402 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  50 
 
 
402 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  47.73 
 
 
402 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  50 
 
 
402 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  48.86 
 
 
416 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  52.22 
 
 
261 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  50 
 
 
419 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  50 
 
 
419 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  50 
 
 
419 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  50 
 
 
419 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  49.43 
 
 
419 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  49.43 
 
 
419 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>