11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2041 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1851  hypothetical protein  91.01 
 
 		 267 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1720  hypothetical protein  66.54 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1436  hypothetical protein  60.15 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  normal  0.0403668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3593  hypothetical protein  58.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42780  hypothetical protein  58.85 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3882  hypothetical protein  58.91 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0219441  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1828  hypothetical protein  58.98 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1406  hypothetical protein  59.35 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1880  hypothetical protein  52.9 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150791  normal  0.563397 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4676  hypothetical protein  28.09 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>