15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1924 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  92.26 
 
 		 155 aa  286  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  60.65 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  53.55 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  54.19 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  51.61 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  49.03 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  50.97 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  31.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0339  flagella synthesis protein FLGN  30.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4794  FlgN family protein  29.86 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3717  FlgN family protein  29.86 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280332  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  29.32 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>