33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0825 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  89.87 
 
 		 79 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  54.43 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  55.7 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  54.22 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  54.43 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  51.28 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  53.33 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  48.1 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  44.09 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  39.47 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  39.47 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  31.88 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  31.58 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  36.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  41.25 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  31.11 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3218  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  32.43 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  40.43 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0721  hypothetical protein  45.71 
 
 		 75 aa  40.8  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000996835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1505  hypothetical protein  51.61 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0203  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  51.72 
 
 		 225 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>