25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0240 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 83 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  93.9 
 
 		 82 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  54.76 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  58.67 
 
 		 75 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  52.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  56 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  53.33 
 
 		 75 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  48.68 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  35.8 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  34.15 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  39.62 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.56 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  32.93 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 87 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  31.4 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  28.57 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>