22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5684 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5684  HDOD domain-contain protein  100 
 
 		 503 aa  981    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65470  hypothetical protein  95.03 
 
 		 503 aa  896    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0623  HDOD  57.34 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4954  hypothetical protein  52.82 
 
 		 511 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0560  hypothetical protein  53.23 
 
 		 511 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0511  signal transduction protein  53.43 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4698  metal-dependent hydrolase HDOD  54.53 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4782  metal-dependent hydrolase HDOD  53.72 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4906  metal-dependent hydrolase HDOD  53.32 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4959  metal-dependent hydrolase HDOD  53.32 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  22.26 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.62 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  25.7 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  23.15 
 
 		 277 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>