60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4888 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  97.24 
 
 		 326 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  68.1 
 
 		 326 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  69.82 
 
 		 328 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  69.02 
 
 		 325 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  69.33 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  63.41 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  50.59 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.24 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.75 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  35.47 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  33.64 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.47 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  28.62 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  29.34 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.9 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  23.91 
 
 		 603 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.29 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  24.48 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  27.27 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.18 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  25.52 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  23.59 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  27.43 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  27 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  27 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  27 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  22.26 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  27.52 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  25.57 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  27.79 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.84 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.57 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.04 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  23.61 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.6 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.38 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  24.04 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.91 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.63 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.16 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  25.57 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  23.88 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.61 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.38 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.46 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  26.3 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  23.31 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.53 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.36 
 
 		 509 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.37 
 
 		 511 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  26.92 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.68 
 
 		 754 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.91 
 
 		 379 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  26.24 
 
 		 175 aa  42.7  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.07 
 
 		 528 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.160239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>