17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2990 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35470  hypothetical protein  98.16 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.030822  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0552  Cro/CI family transcriptional regulator  78.31 
 
 		 269 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0497  Cro/CI family transcriptional regulator  77.94 
 
 		 269 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0531  Cro/CI family transcriptional regulator  77.94 
 
 		 269 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0540  Cro/CI family transcriptional regulator  77.94 
 
 		 269 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0134  helix-turn-helix domain-containing protein  72.06 
 
 		 272 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0788  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 270 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2650  transcriptional regulator  45.32 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00061055  normal  0.037615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0390  hypothetical protein  32.45 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2182  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293373  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4501  helix-turn-helix domain protein  34.33 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6961  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6303  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.519477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1526  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1093  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0872  XRE family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>