More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2599 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  96.94 
 
 
327 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  75.23 
 
 
328 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  73.31 
 
 
334 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  73.39 
 
 
333 aa  494  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  73.7 
 
 
333 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  72.78 
 
 
333 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  75.46 
 
 
331 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  72.78 
 
 
333 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  72.19 
 
 
333 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  71.21 
 
 
333 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  48.94 
 
 
332 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  43.62 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  38.51 
 
 
327 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  36.09 
 
 
361 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  36.02 
 
 
331 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  33.65 
 
 
317 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  33.97 
 
 
317 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  38.01 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  38.8 
 
 
319 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  30.93 
 
 
334 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  32.33 
 
 
506 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
392 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
304 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
301 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
408 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
336 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
390 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
336 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
318 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
302 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
309 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
308 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  26.52 
 
 
491 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
322 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
309 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
304 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
319 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
320 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
320 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
320 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  30.08 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  30.08 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  30.08 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
324 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
369 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  28.33 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  29.17 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1774  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
319 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
319 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
354 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  29.48 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1771  anthranilate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.983535  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.92 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  29.39 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>