16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3524 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  98.18 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  98.57 
 
 		 70 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  97.14 
 
 		 70 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  35.29 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  36.54 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  37.78 
 
 		 61 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  36.54 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  36.54 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  35.85 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  39.22 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>