14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2895 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  95.79 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  91.59 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  80.39 
 
 		 218 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  61.7 
 
 		 222 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  64.48 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  63.93 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  62.77 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  62.7 
 
 		 209 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  26.74 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  29.55 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  29.35 
 
 		 435 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  27.07 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>