34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2733 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  93.21 
 
 		 162 aa  246  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  64.15 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  47.06 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  49.38 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  46.84 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  48.1 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  36.81 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  35.58 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  34.87 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  36.2 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  29.19 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  40.37 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  33.74 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  39.38 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  30.88 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  30.54 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  39.32 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  29.03 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  36.59 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  39.82 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  30.92 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  29.03 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  34.69 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  32.03 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  31.06 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  29.05 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  41.09 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>