25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1392 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  95.07 
 
 
223 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  93.27 
 
 
223 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  75.34 
 
 
222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  51.83 
 
 
222 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  50.46 
 
 
222 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  44.25 
 
 
278 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  47.25 
 
 
221 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  46.33 
 
 
222 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1528  hypothetical protein  47.73 
 
 
222 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.862342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.13 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  28.44 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  25.49 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  25.65 
 
 
292 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  33.1 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  26.85 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  36.26 
 
 
997 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  36.26 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  26.99 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  25.89 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  27.27 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  30.98 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0462  hypothetical protein  26.9 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0489  hypothetical protein  34.12 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>