25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1514 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1514  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02201  hypothetical protein  94.35 
 
 
248 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01631  hypothetical protein  69.39 
 
 
245 aa  358  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  68.31 
 
 
243 aa  358  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26691  hypothetical protein  68.57 
 
 
278 aa  355  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0294  hypothetical protein  67.9 
 
 
243 aa  347  7e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01651  hypothetical protein  65.97 
 
 
242 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01671  hypothetical protein  65.55 
 
 
242 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  64.32 
 
 
242 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  65.13 
 
 
242 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  59.55 
 
 
240 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  58.41 
 
 
238 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  58.41 
 
 
238 aa  284  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  58.41 
 
 
238 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  57.52 
 
 
257 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  57.52 
 
 
257 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  56.19 
 
 
237 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  57.02 
 
 
240 aa  269  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  47.73 
 
 
231 aa  221  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  29.53 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  28.06 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  35.37 
 
 
229 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  33.73 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  30.49 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  29.41 
 
 
237 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>