20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1506 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  100 
 
 		 83 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  84.34 
 
 		 83 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  60.98 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  56.63 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  62.2 
 
 		 83 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  56.63 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  54.88 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  54.76 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  54.88 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  54.22 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  54.22 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  53.66 
 
 		 82 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  47.56 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  47.56 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  46.34 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  50 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  45.12 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  43.48 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>