15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88354 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03720  Protein transport protein sec24 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6W0]  47.42 
 
 		 908 aa  795    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00260  ER to Golgi transport-related protein, putative  43.77 
 
 		 920 aa  637    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00276078  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88354  SED5-binding protein 2 (SEC24-related protein 2) component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  100 
 
 		 907 aa  1865    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88822  predicted protein  32.35 
 
 		 774 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  decreased coverage  0.00889443 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  35.36 
 
 		 680 aa  409  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  27.51 
 
 		 1031 aa  345  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  29.31 
 
 		 777 aa  343  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01000  ER to Golgi transport-related protein, putative  23.54 
 
 		 1003 aa  254  6e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779666  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81443  sec-24-like membrane protein involved in ER to Golgi vesicular transport  25.09 
 
 		 939 aa  231  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.181556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48220  predicted protein  23.5 
 
 		 1041 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313872  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  21 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24928  predicted protein  21.99 
 
 		 824 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.490634 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16541  predicted protein  22.47 
 
 		 770 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.700638  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53063  predicted protein  26.28 
 
 		 897 aa  44.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33543  predicted protein  26.14 
 
 		 771 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336143  normal  0.164519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>