20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83340 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  100 
 
 
378 aa  780    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  37.07 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  30.89 
 
 
364 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  29.18 
 
 
348 aa  143  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  31 
 
 
360 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  28.18 
 
 
318 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  26.04 
 
 
310 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  24.62 
 
 
310 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
426 aa  92  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  30.38 
 
 
264 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  25.86 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  26.27 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  25.82 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  25.82 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  23.68 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  25.07 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  24.02 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  24.49 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>