16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_7312 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_7312  predicted protein  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03579  Golgi apparatus membrane protein tvp38 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B7A1]  34.85 
 
 
410 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131419  normal  0.956877 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01720  expressed protein  27.31 
 
 
345 aa  90.5  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02050  expressed protein  22.84 
 
 
694 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.396797  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00410  cytoplasm protein, putative  21.63 
 
 
662 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02670  cytoplasm protein, putative  29.52 
 
 
501 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  33.65 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  27.45 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  27.37 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  26.62 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  23.6 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  24.68 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  24.68 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  25.56 
 
 
185 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>