12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56797 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_56797  predicted protein  100 
 
 
870 aa  1779    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06897  transmembrane GTPase Fzo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13392)  35.94 
 
 
935 aa  514  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03260  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
887 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.8 
 
 
564 aa  56.2  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  20.66 
 
 
693 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.39 
 
 
605 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  21.74 
 
 
546 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.79 
 
 
952 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  23.19 
 
 
583 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.41 
 
 
548 aa  48.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.71 
 
 
674 aa  45.8  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  23.59 
 
 
390 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>