19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46178 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_46178  predicted protein  100 
 
 
445 aa  930    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  34.74 
 
 
491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47288  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.451932  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44442  predicted protein  30.86 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  30.34 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00570  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351381  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29727  predicted protein  22.22 
 
 
511 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990942  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
290 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.68 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  21.55 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.59 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  27.89 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
290 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
291 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 
290 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  35.59 
 
 
323 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
302 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>