15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40810 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40810  cytosolic large ribosomal subunit  100 
 
 		 49 aa  98.2  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.430633  normal  0.0769127 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02301  conserved hypothetical protein  87.76 
 
 		 51 aa  87.8  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.316305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16125  predicted protein  77.55 
 
 		 50 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22124  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30656  Cytosolic 80S ribosomal protein L39; Cytosolic 60S large ribosomal protein L39  75.51 
 
 		 51 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00482323  normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_006686  CND05700  conserved hypothetical protein  75.51 
 
 		 51 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0202  ribosomal protein L39e  44.9 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.768835  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  47.92 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  46.67 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  45.24 
 
 		 51 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0828  50S ribosomal protein L39e  43.75 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00308743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1264  50S ribosomal protein L39e  42.86 
 
 		 52 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1234  Ribosomal protein L39e  47.73 
 
 		 50 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.477191  normal  0.681248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1884  50S ribosomal protein L39e  47.62 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.225461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1480  50S ribosomal protein L39e  45.24 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000000312587  hitchhiker  0.000439629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1970  50S ribosomal protein L39e  42.86 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>