18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30020 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_30020  predicted protein  100 
 
 
404 aa  826    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201529  normal  0.620116 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03420  Hob1p, putative  27.24 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.233643  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67177  predicted protein  24.61 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07760  SH3 domain signalling protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07670)  50 
 
 
455 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448426  normal  0.219006 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02516  actin-associated protein (Eurofung)  24.58 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219609  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  45.76 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00910  glycosyl transferase, putative  40.26 
 
 
660 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01840  cell division control protein 25, putative  49.15 
 
 
1368 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02066  Class E vacuolar protein-sorting machinery protein hse1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL4]  48.98 
 
 
581 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  46.15 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04880  hypothetical protein  37.29 
 
 
693 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.693409  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86838  predicted protein  23.25 
 
 
274 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 
663 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50804  predicted protein  21.92 
 
 
264 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32905  predicted protein  44.9 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0302596  normal  0.166327 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11147  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 
118 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000131571 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80641  predicted protein  31.94 
 
 
606 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02130  cell division control protein Cdc25, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16240)  32.31 
 
 
1241 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>