32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46871 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  100 
 
 
575 aa  1185    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34722  predicted protein  26.57 
 
 
524 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0720158  normal  0.0311419 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14780  predicted protein  30.42 
 
 
514 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.116373 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27063  predicted protein  30.15 
 
 
813 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00530914  hitchhiker  0.0000354859 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  26.53 
 
 
488 aa  94  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30782  predicted protein  26.11 
 
 
515 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799885  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  30.33 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  25.87 
 
 
519 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43434  chloroplast lysine N-methyltransferase  26.9 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000449884  normal  0.898898 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  25.36 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16466  predicted protein  28.4 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16391  predicted protein  24.71 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42613  predicted protein  23.51 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06568  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G04520)  26.18 
 
 
484 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622081  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48703  predicted protein  23.21 
 
 
344 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.790939  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  24.79 
 
 
611 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28212  predicted protein  25.6 
 
 
495 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.19293 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30906  predicted protein  34.62 
 
 
303 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05630  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11040)  24 
 
 
707 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.246527 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42601  predicted protein  21.98 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04000  cytoplasm protein, putative  25.14 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32860  predicted protein  26.26 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89730  predicted protein  27.23 
 
 
484 aa  54.3  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00881684 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04230  nucleus protein, putative  23.08 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14839  predicted protein  31.78 
 
 
425 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07340  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
441 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656294  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30402  predicted protein  27 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305478  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  22.52 
 
 
1068 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27297  predicted protein  25.36 
 
 
375 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645268  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25556  predicted protein  26.06 
 
 
431 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000466514  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37749  predicted protein  25.79 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38974  predicted protein  23.89 
 
 
488 aa  44.3  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>