14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04230 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL04230  nucleus protein, putative  100 
 
 
495 aa  1022    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06568  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G04520)  27.71 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622081  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44298  putative transcription regulator  26.79 
 
 
534 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  24.82 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25650  predicted protein  22.52 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.242335 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16466  predicted protein  24.24 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89730  predicted protein  24.74 
 
 
484 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00881684 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  23.44 
 
 
575 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  22.83 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30782  predicted protein  29.37 
 
 
515 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799885  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43434  chloroplast lysine N-methyltransferase  23.33 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000449884  normal  0.898898 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30738  predicted protein  21.74 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  20.9 
 
 
519 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14780  predicted protein  20.3 
 
 
514 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.116373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>