34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36844 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  100 
 
 
382 aa  792    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  38.05 
 
 
434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  37.56 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  39.02 
 
 
227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  37.85 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  32.88 
 
 
281 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  33.53 
 
 
322 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  36 
 
 
282 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  30.56 
 
 
218 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  30.52 
 
 
265 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  25.98 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  26.39 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  27.94 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  28.08 
 
 
213 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  27.95 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  27.59 
 
 
316 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.8 
 
 
251 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  28.09 
 
 
250 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  26.6 
 
 
246 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
739 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
1005 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.81 
 
 
725 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  25.85 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  29.03 
 
 
250 aa  44.3  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
1034 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  24.82 
 
 
241 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
909 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  25 
 
 
224 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  25 
 
 
224 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.45 
 
 
222 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>