16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54920 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_54920  predicted protein  100 
 
 
309 aa  639    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27100  fructose-2,6-bisphosphatase  32.23 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.08 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 
190 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_93538  predicted protein  26.64 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0108405  normal  0.381062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 
190 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 
190 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
207 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
220 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>