24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48029 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  100 
 
 
315 aa  637    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  44.32 
 
 
198 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26075  predicted protein  36.73 
 
 
186 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  41.38 
 
 
193 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  36.36 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1361  Abortive infection protein  41.79 
 
 
192 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.211938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  39.56 
 
 
515 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1193  abortive infection protein  37.18 
 
 
203 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  36.25 
 
 
281 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  33.85 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  26.55 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1506  Abortive infection protein  38.95 
 
 
186 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0652668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3402  Abortive infection protein  38.57 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  31.43 
 
 
193 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  33.33 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  24.61 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  33.33 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  35.96 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  31.07 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  36.23 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  38.3 
 
 
200 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  34.67 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1274  abortive infection protein  40.74 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1122  abortive infection protein  35.59 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90846  hitchhiker  0.0094242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>