21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47092 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  25.65 
 
 
223 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  35.42 
 
 
997 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  26.48 
 
 
223 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  35.42 
 
 
233 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  26.84 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  27.47 
 
 
222 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  28.09 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93398  predicted protein  27.69 
 
 
329 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  27.47 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  24.68 
 
 
222 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  35.48 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  34.65 
 
 
222 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  27.03 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  23.18 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  23.77 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  25.79 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  29.36 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  26.4 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  30.43 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  26.09 
 
 
233 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>