33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45252 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45252  predicted protein  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56522  predicted protein  43.62 
 
 
230 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44374  predicted protein  55.65 
 
 
230 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  31.87 
 
 
137 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49634  predicted protein  31.46 
 
 
621 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387641  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  34.67 
 
 
105 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  35.71 
 
 
123 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  35.71 
 
 
123 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  31.94 
 
 
123 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  31.11 
 
 
108 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  33.75 
 
 
117 aa  45.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  32.35 
 
 
131 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  31.46 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  30.3 
 
 
113 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.58 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  34.25 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  40.58 
 
 
731 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  33.87 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  33.72 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  39.29 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  42.59 
 
 
513 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  33.9 
 
 
105 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.25 
 
 
129 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  29.35 
 
 
124 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  38.18 
 
 
406 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  34.21 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  28.4 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  29.17 
 
 
123 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  37.29 
 
 
106 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  31.58 
 
 
104 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 
626 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  32.89 
 
 
104 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  38.18 
 
 
131 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>