27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4307 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  100 
 
 
441 aa  868    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  99.32 
 
 
441 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  71.63 
 
 
483 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  69.44 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  62.71 
 
 
458 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  63.79 
 
 
454 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  63.5 
 
 
468 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  64.43 
 
 
453 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  47.37 
 
 
495 aa  393  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  45.3 
 
 
429 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49534  predicted protein  27.07 
 
 
610 aa  143  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47802  predicted protein  24.61 
 
 
600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0956  hypothetical protein  23.73 
 
 
560 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1267  major facilitator superfamily permease  25.99 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.633668  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35682  FBT family transporter: folate/pteridine  32.26 
 
 
292 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  22.32 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  23 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32854  FBT family transporter: folate/pteridine  26.86 
 
 
547 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  21.63 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1506  hypothetical protein  27.65 
 
 
564 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0478439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  21.94 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  21.43 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  22.73 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0052  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
394 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0533756  normal  0.852382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 
396 aa  43.5  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  23.1 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.51 
 
 
426 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>