18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2070 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  98.91 
 
 
274 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  51.41 
 
 
223 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  51.41 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  47.62 
 
 
238 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  39.66 
 
 
232 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3767  hypothetical protein  40.13 
 
 
279 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1598  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3811  hypothetical protein  35.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.379378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  41.67 
 
 
155 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1045  hypothetical protein  46.15 
 
 
159 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  30.5 
 
 
462 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3809  hypothetical protein  40.43 
 
 
187 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.376862 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  32.56 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  31.25 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3176  hypothetical protein  39.29 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  43.64 
 
 
209 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>