20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1971 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  100 
 
 
82 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  98.78 
 
 
82 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  79.27 
 
 
82 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  79.27 
 
 
82 aa  140  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  76.83 
 
 
82 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  78.05 
 
 
82 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  70.73 
 
 
82 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  64.71 
 
 
85 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  53.01 
 
 
83 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  54.22 
 
 
83 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  51.19 
 
 
83 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  50.6 
 
 
83 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  48.19 
 
 
83 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  51.22 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  48.19 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  51.19 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  47.56 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  50 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  46.99 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  51.06 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>