17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1965 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  63.35 
 
 
286 aa  359  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  58.36 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  57.04 
 
 
290 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  35.27 
 
 
277 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  37.45 
 
 
274 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.84 
 
 
951 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  31.89 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  27.62 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  30.32 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  23.53 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  26.27 
 
 
320 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  27.46 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0721  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.18 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.37 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.84 
 
 
366 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>