20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1315 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1315  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3317  hypothetical protein  37.23 
 
 
469 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3928  hypothetical protein  35.21 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645053  hitchhiker  0.00282237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  30.97 
 
 
259 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  30.09 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  60.61 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  60.61 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  44.83 
 
 
232 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  60.61 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  60.61 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  37.14 
 
 
139 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  41.46 
 
 
184 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  28.93 
 
 
240 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  41.46 
 
 
139 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  41.86 
 
 
126 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  34.29 
 
 
139 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  29.37 
 
 
286 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1598  IS1 transposase  45.71 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  47.06 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>