16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3317 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3317  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  958    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1315  hypothetical protein  37.23 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3928  hypothetical protein  33.75 
 
 
469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645053  hitchhiker  0.00282237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  43.9 
 
 
184 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  43.9 
 
 
139 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  48.48 
 
 
230 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  48.48 
 
 
230 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  48.48 
 
 
230 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  48.48 
 
 
230 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  42.59 
 
 
108 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  43.59 
 
 
126 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  45.71 
 
 
139 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  45.71 
 
 
139 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
262 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1101  insertion element protein  53.12 
 
 
108 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  50 
 
 
342 aa  43.9  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>