15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  98.85 
 
 		 87 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  65.52 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  62.07 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  63.22 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  60.92 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  58.62 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  59.77 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  46.34 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  42.65 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1521  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  38.57 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  35.16 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0974  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.555742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>